摘要
目标:利用CRISPR Cas13a诱导BCR-ABL基因沉默。 背景:CML是一种克隆性骨髓增生性多能干细胞疾病,由染色体9和22之间的相互易位驱动,形成BCR-ABL融合基因。像伊马替尼这样的酪氨酸激酶抑制剂药物是治疗的主要药物,如果没有相容的干细胞供体,对这些药物有耐药性的病例预后较差。然而,随着基因编辑技术的快速发展,目前大多数研究都集中在开发一种针对单基因疾病的翻译模型,具有潜在的永久治愈。 目的:探讨RNA靶向CRISPR-Cas13a系统在CML细胞系K562中有效敲除BCR-ABL融合转录本的潜在应用价值。 方法:设计特异于嵌合BCR-ABL基因的CRISPR Cas13a crRNA,并将该系统作为双质粒系统转染到CML细胞系K562中。通过评估依赖于BCR-ABL基因表达的下游基因的表达水平来列举影响。此外,下一代测序也被用来确定CRISPR对该基因的影响。 结果:CRISPR系统成功降低了依赖于激活的BCR-ABL激酶信号的下游基因[pCRKL和pCRK]的表达高达4.3倍。crispr处理后的细胞活力也显著降低了373.83倍[p-value= 0.000891196]。时间依赖动力学也强调了显著的体外抑制活性,可持续长达8周[p-value: 0.025]。根据Oxford MinION下一代测序器的cDNA测序数据,CRISPR处理的细胞显示62.37%的疑似裂解读取。 结论:这些初步结果突出了RNA靶向CRISPRs在血液学肿瘤(如CML)中的极好的潜在应用,并为这一方向的进一步研究铺平了道路。
关键词: CRISPR,肿瘤学,分子生物学,血液学,RNA裂解,BCR-ABL
图形摘要
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