摘要
WDFY3新抗原作为肝外胆管癌长期存活者预后标志物的鉴定 背景:新抗原是新形成的抗原,以前未被免疫系统识别。它们可能是由于突变而形成的肿瘤蛋白质改变而引起的。尽管新抗原最近已与癌症的长期幸存者(例如黑色素瘤和结肠直肠癌)的抗肿瘤免疫力相关联,但它们在许多癌症类型中的预后和免疫调节作用仍然不确定。 目的:本研究的目的是确定肝外胆管癌(EHCC)长期存活的预后指标。 方法:我们结合全外显子组测序(WES),RNA测序(RNA-seq),计算生物物理学和免疫组织化学研究了EHCC的新抗原,EHCC是一种罕见的侵袭性癌症,其5年总生存率低于10%。 结果:我们的分析显示,IC50 <500 nM时,高质量新抗原负荷的中性粒细胞浸润相关趋势有所降低(r = -0.445,P = 0.043)。在检查的24例EHCC患者中,我们在短期存活者中确定了4名具有WDFY3新抗原的长期存活者,而没有一名携带WDFY3新抗原的长期存活者。 WDFY3新抗原与中性粒细胞浸润(p = 0.013)降低,CCL5(p = 0.025),CXCL9(p = 0.036)和TIGIT(p = 0.016)的表达降低以及预后不良(p = 0.030)相关。 。相反,预后与肿瘤突变负担,新抗原负荷或免疫细胞浸润没有显着相关。 结论:我们建议WDFY3新抗原可能通过调节抗肿瘤免疫力来影响预后,并且WDFY3新抗原可能被用作EHCC免疫治疗的潜在靶标。
关键词: 肝外胆管癌,WDFY3新抗原,预后,免疫细胞浸润,免疫特征基因,肿瘤突变负担。
图形摘要
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